299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2195 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  100 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  98.18 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  89.42 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  66.41 
 
 		 142 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  62.1 
 
 		 134 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  62.9 
 
 		 135 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  58.87 
 
 		 141 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  65.32 
 
 		 135 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  65.32 
 
 		 135 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  62.1 
 
 		 135 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  61.29 
 
 		 137 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  62.9 
 
 		 135 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  41.15 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  58.87 
 
 		 142 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  55.65 
 
 		 141 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  58.06 
 
 		 135 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  54.84 
 
 		 135 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  50.81 
 
 		 137 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  50.41 
 
 		 144 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  52.85 
 
 		 134 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  48.82 
 
 		 137 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  41.74 
 
 		 147 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  59.21 
 
 		 91 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  59.21 
 
 		 91 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  40.54 
 
 		 139 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  34.4 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.65 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  35.65 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  32.09 
 
 		 139 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  35.96 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.96 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  35.96 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  37.96 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  35.96 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  34.35 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  39.25 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  36.94 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  36.94 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  36.94 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  39.64 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  36.52 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  38.02 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  34.19 
 
 		 144 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  36.61 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  36.52 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  36.52 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  36.52 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3452  umuD protein  55.71 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000303705  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.65 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  35.9 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  38.68 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  36.45 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  35.9 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  62.07 
 
 		 75 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  34.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  34.82 
 
 		 138 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.46 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.14 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  35.71 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.71 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  35.9 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  31.93 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  35.78 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  31.25 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  37.61 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  30.4 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  35.71 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.26 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  38.14 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  31.3 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  35.71 
 
 		 141 aa  72  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.74 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  32.76 
 
 		 142 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.92 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  31.82 
 
 		 138 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  39.45 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  32.76 
 
 		 171 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.34 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.06 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  33.04 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  31.4 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  36.21 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.06 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  31.9 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  33.64 
 
 		 139 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  33.06 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  34.95 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.3 
 
 		 138 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.95 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  30.97 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>