118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1988 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12249  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1876  hypothetical protein  97.8 
 
 		 91 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  57.3 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  56.1 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  56.63 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  59.21 
 
 		 274 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  51.61 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1782  putative prophage repressor  59.21 
 
 		 274 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  60.87 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  63.08 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  59.42 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  54.65 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  54.65 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  56.58 
 
 		 274 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.39 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.33 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  47.31 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.15 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  53.62 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.79 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  52.17 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  54.1 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  51.47 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  38.67 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  47.14 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  45.33 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  45.33 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  45.33 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  45.9 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  37.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  37.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  37.84 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  53.09 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  36.9 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  38.55 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  38.55 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  45.76 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  43.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  40 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.83 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  38.67 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  37.84 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  41.77 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  38.89 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  32.56 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  43.28 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  35.62 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  37.97 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.49 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.33 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.14 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1635  umuD protein  44.83 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  37.97 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  35.21 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  40.3 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  43.33 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  34.21 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  40.98 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.16 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.16 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  38.55 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.24 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  38.16 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  41.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.16 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  36.71 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.03 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  37.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  37.08 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  37.93 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  39.34 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  36.11 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.57 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  38.81 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  33.8 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  39.44 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  31.08 
 
 		 238 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  37.5 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  37.7 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  30.99 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.14 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  39.62 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  36.07 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>