75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3519 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3519  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  86.89 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  83.33 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  81.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  75 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  61.67 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  61.67 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  60 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  60.34 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  52 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.94 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  56.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  54 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.86 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  47.83 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  42.42 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  52.27 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  53.06 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.83 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  44.9 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  46.51 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  46.51 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  46.67 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  43.1 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  46.67 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  38.6 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  34.85 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  37.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  50 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  51.06 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  43.48 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  43.48 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.48 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  47.83 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.18 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.83 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.44 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  34.43 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  39.66 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  38.6 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  39.39 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  46.81 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  40.74 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  34.62 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  38.89 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  45.83 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  36.54 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.44 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  45.45 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  37.78 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1981  SOS-response transcriptional repressors (RecA- mediated autopeptidase)-like protein  50 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125768  normal  0.0169516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  45.24 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  35 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  37.04 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  42.86 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  50 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  44.44 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  41.18 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  44.19 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  32.76 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.64 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0336  hypothetical protein  43.9 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  51.35 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  35.19 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  50 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  38.64 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>