84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0336 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0336  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  50.94 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  50.94 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  51.72 
 
 
208 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  49.06 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  49.06 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  55.32 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  55.32 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.45 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  47.17 
 
 
186 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  57.5 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  55.56 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  47.17 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  50.98 
 
 
212 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  41.82 
 
 
206 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  41.18 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  46.15 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  46.15 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.11 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  41.51 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  43.4 
 
 
238 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  37.93 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  56.76 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.45 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  45.45 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  45.45 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  45.9 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  45.45 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.4 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.82 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  39.62 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  47.5 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  42.59 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  40.35 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.11 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.83 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  35.59 
 
 
202 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  47.5 
 
 
143 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  41.51 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  46.67 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  30.26 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  40.91 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  30.26 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  44.44 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  50 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  47.5 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  44.44 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  46.67 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  43.4 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1981  SOS-response transcriptional repressors (RecA- mediated autopeptidase)-like protein  45.45 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125768  normal  0.0169516 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  43.48 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  43.9 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  43.4 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  39.13 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  40.43 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  43.75 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  39.66 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  51.35 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.95 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  44.74 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  41.51 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  42.31 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3519  hypothetical protein  43.9 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  46.34 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  32.76 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  34.92 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.5 
 
 
150 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  31.43 
 
 
168 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1407  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  43.9 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  37.84 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  35.09 
 
 
141 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>