197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1981 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1981  SOS-response transcriptional repressors (RecA- mediated autopeptidase)-like protein  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125768  normal  0.0169516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  56 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  59.42 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  57.58 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  53.33 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  60 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  60.61 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  53.62 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  50.67 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  57.58 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  58.06 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  58.06 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  49.33 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  49.33 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  57.14 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  59.09 
 
 		 238 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  49.33 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  61.9 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  52.31 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  55.56 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  51.56 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.56 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  54.84 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  48 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  60.94 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  48 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  53.03 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  49.3 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.37 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  49.3 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  57.58 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  50 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  59.32 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  56.67 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  56.92 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  41.67 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  45.45 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  49.28 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.57 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  52.38 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  54.55 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  51.52 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  50.75 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  45.83 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  47.06 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  47.83 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  52.31 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  56.06 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  54.69 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  52.38 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  52.54 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7045  peptidase S24 and S26 domain protein  49.21 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  49.25 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  53.03 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  51.52 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  57.69 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  53.03 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  55.56 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  46.97 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  54.24 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4997  peptidase S24 and S26 domain protein  46.97 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  51.52 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  50 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  50 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  44.16 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  50 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  53.03 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  55.77 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  46.88 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  46.97 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  51.52 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2172  SOS-response transcriptional repressor LexA -like protein  48.39 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  43.55 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  52.31 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  50.79 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  51.85 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  48.48 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2196  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.16 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.705592  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  53.7 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.48 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  47.62 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  46.15 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  49.09 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  47.69 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  44.44 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  46.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  53.7 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1833  putative prophage repressor  49.15 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  50.91 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>