More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0755 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0755  SOS-response transcriptional repressor  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  48.35 
 
 
186 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  45.26 
 
 
243 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.9 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.92 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  43.48 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  44.21 
 
 
202 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.94 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  44.94 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.82 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  44.94 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  45.05 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  45.16 
 
 
238 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  38.14 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  47.67 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  40.62 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  40.62 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  39.8 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  49.43 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  42.45 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  39.39 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  37.76 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  37.76 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  37.76 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  46.51 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  44.57 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.22 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  40.22 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  43.37 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.7 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  39.36 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  35.42 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  47.67 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  40 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.83 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  37.63 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  42.22 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  40.91 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  37.36 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  37.11 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  39.53 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  38.38 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  38.38 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.38 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  38.38 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  38.04 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  38.46 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  37.78 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.46 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  38.14 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  44.57 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  40.24 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  41.86 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  43.02 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  40.22 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  35.48 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  41.46 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  39.29 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  34.62 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  39.39 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  39.44 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  39.44 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  31.96 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  38.2 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  39.51 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  36.08 
 
 
249 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  35.48 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  41.33 
 
 
256 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  37.36 
 
 
241 aa  61.6  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  39.18 
 
 
288 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  39.29 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.08 
 
 
238 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  35.48 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  33.67 
 
 
219 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  40.48 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.25 
 
 
222 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  38.14 
 
 
236 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  38.67 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  34.26 
 
 
227 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  31.52 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  33.64 
 
 
235 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  33.64 
 
 
235 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  36.84 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  33.64 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.05 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  37.18 
 
 
204 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  38.1 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.56 
 
 
233 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  40.51 
 
 
232 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2300  LexA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
199 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147613  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.62 
 
 
207 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  33.03 
 
 
215 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  35.48 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  33.03 
 
 
215 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  33.03 
 
 
215 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>