78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1743 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  100 
 
 		 235 aa  473  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  80.6 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  40.25 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  29.44 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  42.15 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  45.05 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2836  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.46 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0838943  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  39.08 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  35.14 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  37.97 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  37.97 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  40.91 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  41.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  42.86 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.08 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  39.13 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.08 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  35.56 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  43.55 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  42.53 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  34.26 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  35 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  36 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  32.56 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  39.56 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  33.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  35 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  35.63 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  41.46 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1416  putative phage repressor  37.21 
 
 		 100 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  34.52 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  36.78 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  34.52 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  37.33 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  34.88 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  25.79 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.82 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.66 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  38.27 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  25.2 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1017  putative phage repressor  46.97 
 
 		 133 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.992062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  30.93 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.08 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  38.2 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  28.95 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  34.78 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  28.95 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  32.32 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  35.56 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  34.12 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  32.26 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  31.51 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  32.69 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  35.96 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  41.27 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.86 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  25.25 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  34.02 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  40 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.57 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1049  peptidase S24, S26A and S26B  39.34 
 
 		 257 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.140554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  35.06 
 
 		 302 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  31.71 
 
 		 197 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.72 
 
 		 208 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  35.09 
 
 		 238 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 237 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  31.82 
 
 		 241 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.25 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  33.75 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>