83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2620 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  100 
 
 
144 aa  293  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  60.84 
 
 
214 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  47.92 
 
 
251 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  47.92 
 
 
204 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  45.77 
 
 
240 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  35.82 
 
 
234 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  32 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.06 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.06 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  35.37 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.58 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  40 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  37.93 
 
 
289 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  37.93 
 
 
289 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  36.78 
 
 
280 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  36.78 
 
 
289 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  33.71 
 
 
261 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  36.08 
 
 
302 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 
210 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  35.87 
 
 
247 aa  57.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.88 
 
 
213 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.85 
 
 
216 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  42.31 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  34.45 
 
 
230 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30.53 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 
248 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.59 
 
 
235 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  37.93 
 
 
206 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.26 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  32.26 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  34.94 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  31.9 
 
 
283 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  38.46 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  52  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.5 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  34.72 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  32.53 
 
 
216 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28.18 
 
 
249 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  37.33 
 
 
210 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  33.33 
 
 
245 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  38.57 
 
 
273 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  32.41 
 
 
219 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  33.33 
 
 
224 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.55 
 
 
209 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.21 
 
 
229 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.85 
 
 
193 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  31.91 
 
 
240 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  33.33 
 
 
233 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  30.09 
 
 
216 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  36 
 
 
235 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  30.83 
 
 
239 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  33.75 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  34.78 
 
 
264 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  39.19 
 
 
269 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.08 
 
 
233 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.03 
 
 
227 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.32 
 
 
247 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.12 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  29.79 
 
 
206 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  26.52 
 
 
292 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.07 
 
 
247 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.74 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  27.41 
 
 
244 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  37.04 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.7 
 
 
219 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  37.04 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  34.15 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  37.04 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  28.72 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  35.8 
 
 
205 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 
270 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  30.14 
 
 
819 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  29.09 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.18 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  26.55 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.71 
 
 
231 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  23.57 
 
 
244 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  34.57 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.12 
 
 
214 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.71 
 
 
263 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  32.94 
 
 
143 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0232979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>