54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1124 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  73.48 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  71.74 
 
 		 244 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  46.1 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.15 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  30.3 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  29.13 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.93 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.94 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  31.01 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.39 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  34.09 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.18 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  29.36 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  35.33 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  26.5 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  35.33 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.56 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.23 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  30.53 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.34 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.34 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.95 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.2 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  28.12 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.4 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.84 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.43 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  26.28 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  29.46 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  24.77 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  22.16 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  29.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.01 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  24.07 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  23.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.41 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  17.86 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.16 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  37.5 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  27.17 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  24.03 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.87 
 
 		 273 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.12 
 
 		 227 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>