127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2371 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  44.93 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  44.74 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  44 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  45 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  43.7 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  40.85 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  42.86 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  43.7 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  41.41 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  40.43 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  33.82 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  39.13 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.73 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  36.91 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.9 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  41.13 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  35.56 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  34.56 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  35.66 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  43.48 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  32.95 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  35.66 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  34.76 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  33.77 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  35.61 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.76 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.14 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  36.24 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.03 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  29.34 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  36.36 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.77 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  34.71 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  47.42 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  34.23 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  34.71 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  29.65 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  36.36 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  36.36 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  34.78 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  32.43 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.93 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.71 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.03 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  32.14 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  33.79 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  33.88 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  36.11 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.71 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  31.68 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.14 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.71 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.71 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  35.54 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  30.66 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.1 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  38.74 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  29.06 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  24.77 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  36.36 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  34.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  25.22 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  29.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  33.33 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  35.35 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  32.56 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  34.44 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  35.56 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  34.09 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  31.62 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  31.62 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.49 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  34.44 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  38.2 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  38.04 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.45 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  29.63 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.47 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  39.56 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.45 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  40 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  29.17 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  36.59 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  31.58 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  30.08 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>