126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  98.44 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  47.84 
 
 		 237 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  47.03 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  44.44 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  48.65 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  46.88 
 
 		 263 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  43.27 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  43.93 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  43.93 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  43.51 
 
 		 233 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  43.78 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  43.35 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  43.35 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  56 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  39.66 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  40.08 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  42.44 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  40.69 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  40.69 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  40.66 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  39.27 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  38.89 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  36 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  43.64 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  37.95 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  37.04 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  34.84 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  33.49 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  33.49 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.35 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  30.46 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  30.5 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.51 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.62 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.75 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  28.74 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.94 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.46 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.94 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  27.59 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.43 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  26.25 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.43 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.69 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.05 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.78 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.14 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.14 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.34 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.68 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  26.69 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  26.69 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.57 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.56 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  43.33 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  29.24 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.03 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  30.65 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  47.14 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  29.59 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  37.4 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  26.86 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  36.94 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.89 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  35.25 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5837  PAS  31.53 
 
 		 341 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  28.19 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  25.61 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.75 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  23.97 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  25.44 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.39 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  27.5 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  24.48 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.12 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  34 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  34.21 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6023  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  23.77 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  28.39 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  24.68 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  38.2 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  25.82 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>