44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0589 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  71.12 
 
 		 233 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  68.1 
 
 		 278 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  67.67 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  41.87 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  41.91 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  25.85 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  26.86 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.35 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.69 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  25.63 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.75 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  25.85 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  25.63 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  24.79 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.2 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  26.2 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  31.25 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.32 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.93 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  24.89 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  24.19 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  22.13 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  26.52 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  22.61 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  25.52 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.08 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  24.69 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.79 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  28 
 
 		 480 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  20 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  23.92 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  28.32 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  21.74 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.35 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  23.18 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23.83 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  23.76 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  23.86 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>