76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1135 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  100 
 
 		 270 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  83.47 
 
 		 248 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  47.29 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  43.64 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  43.64 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  40.79 
 
 		 225 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  54.61 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  42.11 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  46.15 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.18 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40.81 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  40.36 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40.36 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  38.94 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  39.29 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  39.74 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  38.86 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  35.98 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  41.98 
 
 		 218 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  34.25 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  33.86 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  35.26 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  39.16 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  36.91 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.4 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.51 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  36.23 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  38 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.07 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  24.47 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  24.79 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  33.09 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.04 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  35.43 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  35.45 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  30.37 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0176  hypothetical protein  30.09 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.91 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  24.08 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.27 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  27.5 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  32.62 
 
 		 248 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.29 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  34.74 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  22.57 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  26.73 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  30.92 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.08 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.34 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.27 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.25 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  25.61 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  22.82 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.11 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.79 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  28.79 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  24.84 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  31.82 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  26.36 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  29.85 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  24.15 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  22.95 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  25.91 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.05 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 140 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  26.34 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.31 
 
 		 212 aa  42  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>