163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4494 on replicon NC_011665
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  43.4 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  32.87 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  34.34 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.14 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.97 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  30.53 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.78 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.79 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.79 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.34 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.34 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.75 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.22 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  23.89 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25.94 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  25.94 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.85 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  26.64 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  26.32 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.64 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.82 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  31.91 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  24.79 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.71 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  27.19 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.86 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.23 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  27.07 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.76 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.32 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.64 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.23 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.34 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  25 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  28.24 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.46 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.52 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  23.5 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  28.3 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.64 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.64 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  24.23 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  25.22 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.42 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.1 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  26.23 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  30.08 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  22.52 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  29.47 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.03 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  31.58 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  23.68 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  24.79 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  24.79 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  24.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  24.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  24.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  22.07 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  29.82 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.77 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.03 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  27.42 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  39.39 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  26 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  30.53 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  38.71 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  27.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  26 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  24.18 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  38.2 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  21.27 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  24.06 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.34 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  21.67 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  25.51 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  28.39 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  29.01 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 116 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  29.6 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  20.69 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  29.79 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  27.37 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  27.43 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.09 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  33.33 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  26.67 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>