109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0786 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  87.62 
 
 		 210 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  95.24 
 
 		 210 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  89.9 
 
 		 208 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  83.33 
 
 		 210 aa  363  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  83.33 
 
 		 210 aa  360  9e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  60 
 
 		 225 aa  281  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  61.9 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  58.99 
 
 		 217 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  59.05 
 
 		 210 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  55.24 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.24 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  54.76 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  58.93 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  57.34 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  57.34 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  52.02 
 
 		 223 aa  225  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  56.74 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  54.88 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  56.89 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  56 
 
 		 225 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.12 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  57.14 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.15 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  46.89 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  42.17 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  41.51 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  35.24 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  34.4 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  36.89 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  25.47 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  30 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  28.14 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.51 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.82 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.54 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  32.98 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  29.07 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  21.57 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  33.96 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  25.7 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  30.28 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  33.59 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.67 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  33.59 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.41 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  24.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  24.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  24.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  27.22 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  26.21 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  38.37 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 281 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  23.68 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  34.12 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  37.5 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  39.53 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  37.21 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  39.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  28.47 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.35 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  34.72 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  33.78 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  36.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.54 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.96 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.92 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.3 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.05 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  37.04 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  28.12 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  28.97 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  28.97 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  34.88 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  32.86 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  34.88 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.62 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  27.05 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  36.05 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.74 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  34.88 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  29.63 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  30.83 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  24.59 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  29.58 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  34.88 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  23.56 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  30.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  41.33 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.77 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>