59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1686 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  100 
 
 		 220 aa  453  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 157 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  31.5 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  42.86 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.42 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.88 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  28.49 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  32.34 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  28.64 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.77 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  32.1 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  32.02 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  28.16 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  45.07 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  26.36 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  29.83 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  30.77 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.59 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  39.19 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  27.23 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  25.68 
 
 		 331 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.4 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  26.2 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  29 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.42 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7538  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.0410709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  35.14 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2503  transcriptional regulator, XRE family  65.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  32.14 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  34.18 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  62.86 
 
 		 117 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  26.84 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  29.71 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  27.49 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  25.95 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  32.91 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  25.76 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.91 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  32.91 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.32 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2433  hypothetical protein  29.11 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  32.61 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  26.43 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  24 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  36.11 
 
 		 244 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.35 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 123 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 272 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>