24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4082 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  100 
 
 		 227 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  52.41 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  40.21 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  36.82 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  37.06 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  42.36 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  36.55 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  33.54 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  37.12 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  32.94 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  32.94 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  32.82 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  28.51 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  26.52 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  35.34 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  35.66 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  35.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  27.5 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  30 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  28.75 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  41.54 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  26.43 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>