106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0435 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  62.38 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  57.14 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  60 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  60.95 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  59.52 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  56.88 
 
 		 217 aa  248  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  61.9 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  57.08 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  55.45 
 
 		 210 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  59.52 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  55.66 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.19 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  60 
 
 		 214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  56.42 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  56.42 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  52.44 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  54.26 
 
 		 224 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  53.27 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  55.8 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  55.75 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  57.87 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  49.28 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.89 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  50.85 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  40.09 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  40.78 
 
 		 421 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  34.19 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  31.58 
 
 		 331 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  29.75 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  32.74 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  27.32 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  27.42 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.62 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  31.13 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  38.74 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  38.74 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  27.88 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  37.63 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  37.63 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  35.8 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  35.8 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  42.68 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  37.63 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  31.82 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  28.93 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  28.5 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.78 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.43 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  26.4 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.43 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.13 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.23 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  30.14 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.71 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  37.21 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.78 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  24.51 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  40.48 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  36.05 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  37.21 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  38.37 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  33.9 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  27.07 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  25.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  38.37 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  36.14 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  33.64 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  36.05 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.05 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.59 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  37.21 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.58 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  34.44 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  36.05 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  35.14 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  27.01 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  32.43 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.17 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  39.19 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.06 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  34.04 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  36.11 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.65 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  30.77 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  28.37 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  28.37 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  28.37 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.61 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  25.98 
 
 		 281 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  34.48 
 
 		 158 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  30.17 
 
 		 211 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  31.58 
 
 		 233 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  32.43 
 
 		 232 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>