51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2380 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  100 
 
 		 421 aa  859    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  42.34 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  45.8 
 
 		 240 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  39.24 
 
 		 236 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  33.48 
 
 		 235 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  32.26 
 
 		 211 aa  99.8  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  36.92 
 
 		 210 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  41.03 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  41.35 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  40.57 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  39.81 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  40.78 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  37.38 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  41.12 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  40.74 
 
 		 210 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  39.42 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.49 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  41.98 
 
 		 237 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  37.5 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  37.5 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  31.78 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  27.91 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  37.14 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  30.37 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  33.02 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.02 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  33.02 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  40.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  40.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  39.19 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  36.79 
 
 		 215 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  37.07 
 
 		 225 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  35.59 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0895819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  22.88 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5443  hypothetical protein  29.73 
 
 		 123 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.877927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  28.21 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0291  hypothetical protein  36.59 
 
 		 162 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000155268  normal  0.0378737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  34.57 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  28.72 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  35.44 
 
 		 289 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  35.44 
 
 		 289 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  23.63 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30.91 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  36 
 
 		 237 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  26.76 
 
 		 218 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>