67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0734 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  100 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  52.02 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  51.53 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  52.44 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  51.12 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  50.22 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  49.33 
 
 		 210 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  47.09 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  52.02 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  52.02 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  51.08 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  47.77 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  51.11 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  48.66 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  47.77 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.32 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  48.68 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  52.02 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  45.78 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  45.78 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  48.46 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  49.34 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.15 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.75 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  43.55 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.91 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  25.83 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  26.72 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  27.91 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  30.48 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  27.34 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.83 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  25.66 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.18 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  27.51 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  27.44 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.75 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.24 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  21.15 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  30 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  29.79 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  23.41 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 		 281 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  21 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  31.37 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  29.11 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.08 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  25.64 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  35.62 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  34.83 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.65 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.16 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  36 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  26.5 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  31.82 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  34.72 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  22.99 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  48.98 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  33.33 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  25.34 
 
 		 213 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  28.79 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.75 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  33.72 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>