27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0516 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  49.28 
 
 
208 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  48.33 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  48.82 
 
 
210 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  45.93 
 
 
210 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  48.82 
 
 
210 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  46.89 
 
 
210 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  47.87 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  47.85 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  44.69 
 
 
225 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  46.45 
 
 
210 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  42.2 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  46.89 
 
 
210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  43.56 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.66 
 
 
209 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.65 
 
 
209 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  43.72 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  43.75 
 
 
223 aa  151  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  44.19 
 
 
214 aa  147  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  43.38 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  43.38 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  43.17 
 
 
225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  45.83 
 
 
215 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  43.61 
 
 
225 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  40.09 
 
 
214 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  43.82 
 
 
217 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.17 
 
 
230 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>