20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2209 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  32.02 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  29.96 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  34.86 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  28.15 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  26.16 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.12 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  32.67 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  26.92 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  35.48 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  31.37 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  28.71 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  21.15 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  31 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  31.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  35.53 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  32.22 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.22 
 
 		 210 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  37.08 
 
 		 208 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>