77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0583 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  61.16 
 
 		 217 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  60.71 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  60.27 
 
 		 208 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  59.82 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  68.14 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  62.5 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  62.5 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  58.93 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  67.69 
 
 		 225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  59.82 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  55.11 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  55.56 
 
 		 210 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.56 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  56 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  55.11 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  65.04 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  59.82 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  54.26 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  58.93 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  51.08 
 
 		 223 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  50.66 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.88 
 
 		 209 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.44 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.56 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  40.86 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  39.42 
 
 		 421 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  29.53 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  30.64 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  29.6 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  31.5 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  36.26 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.6 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  28.93 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  24.37 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.22 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  35.66 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.79 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.52 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.52 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.52 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  26.09 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  24.41 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  23.77 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  28.06 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  33.96 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.46 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.95 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  34.68 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  37.8 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  33.03 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  35.21 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  31.48 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.59 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  35.64 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  28.68 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  29.6 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  27.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  34.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  27.86 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  30.56 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.53 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  27.91 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.64 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.53 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  36 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  26.71 
 
 		 230 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.76 
 
 		 233 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  30.34 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  37.18 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>