27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1320 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  100 
 
 		 211 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  70.95 
 
 		 238 aa  313  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  63.96 
 
 		 216 aa  260  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  40.27 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  32.58 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  38.8 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  31.28 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  29.34 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  31.38 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  35.42 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.02 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.42 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  30.34 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  26.63 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  28.71 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  27.84 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  26.13 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  27.81 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  26.8 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  26.46 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  25.65 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  26.84 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  26.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  26.84 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  25.24 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>