28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6554 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  100 
 
 		 245 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  92.07 
 
 		 227 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  38.57 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  43.59 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  36.82 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  31.13 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  32.82 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  36 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  33.58 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  34.59 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  41.24 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.28 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  32.94 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0691  hypothetical protein  30.87 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00140732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0751  hypothetical protein  30.87 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  26.13 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  24.24 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  29.69 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  32.79 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  28.97 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  29.93 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1189  hypothetical protein  22.9 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0775  hypothetical protein  22.9 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6165  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  30.32 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>