58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0789 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  70.95 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  75.25 
 
 		 216 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  41.31 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  36.36 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  35.36 
 
 		 203 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  33.33 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  30.89 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  28.74 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  31.22 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  33.09 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  29.33 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  28.85 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  29.49 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  29.8 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  27.54 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  26.87 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  27.4 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  24.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  25.5 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  28.48 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.48 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  26.05 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  26.05 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  27.5 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  27.88 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  29.5 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  26.07 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  25.14 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  24.15 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  25.45 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  34.35 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  24.15 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.49 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  26.94 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.88 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  24.62 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.83 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  23.81 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  25.56 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1189  hypothetical protein  24.38 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  25.76 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  24.75 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  27.89 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.82 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0775  hypothetical protein  23.88 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  26.58 
 
 		 225 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 367 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  29.33 
 
 		 230 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.11 
 
 		 264 aa  42  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.11 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  24.48 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>