72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0218 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  92 
 
 		 225 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  63.56 
 
 		 217 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  67.69 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  72 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  66.22 
 
 		 218 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  66.22 
 
 		 218 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  59.56 
 
 		 210 aa  274  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  58.67 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  58.15 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  56.89 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  61.78 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  55.11 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  55.8 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  54.87 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  55.31 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  54.87 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  54.42 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  57.78 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  56.89 
 
 		 210 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  50 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  48.46 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  45.05 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  44.44 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.17 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  40.43 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  35.59 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  27.56 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  33.86 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  29.63 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  28.28 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  26.16 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  35.4 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.05 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  33.71 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.5 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  26.91 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  36.89 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  24.29 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  30.16 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  29.78 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  22.48 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  34.17 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.08 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  37.8 
 
 		 126 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.7 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  27.48 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.71 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  32.93 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  22.76 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.01 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  34.4 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  31.54 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  25.31 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  26.19 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.25 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.46 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  26.87 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  40.58 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  28.78 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.43 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  29.55 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.59 
 
 		 196 aa  42  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  23.45 
 
 		 239 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1993  peptidase S24 and S26 domain-containing protein  32.14 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.417465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>