23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0258 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  27.12 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  24.89 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  25.12 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  33.06 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  25.2 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  24.68 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  25 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  25.65 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  26.96 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  22.32 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  24.18 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.77 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  25.81 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.59 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  24.76 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  21.15 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>