35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3352 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  45 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  39.53 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  33.75 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  33.15 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  32.02 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  29.49 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  43.48 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  34.5 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  26.44 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  33.79 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.36 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  24.68 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  31.61 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  30 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4241  hypothetical protein  45 
 
 		 351 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  37.23 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  27.51 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  29.59 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  37.14 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  27.04 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  25.2 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  27.92 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.31 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  34.07 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  25.23 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  29.71 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  32.97 
 
 		 208 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  35.48 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  36.26 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.72 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.89 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  24.7 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  34.72 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  31.87 
 
 		 210 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>