189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0219 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  48.33 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  30.04 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  35.83 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  36.22 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  33.15 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  40.62 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  29.41 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  26.18 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  33.02 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  24.89 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  29.03 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.51 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.71 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.17 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.94 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  32.12 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  39.39 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  39.39 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  27.27 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  24.4 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  24.4 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  34.72 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  40.32 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  25.2 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  30.53 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  22.53 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  33.73 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 133 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  26.36 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  25.36 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.32 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.72 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  34.72 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  34.72 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  32.48 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  22.83 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  34.43 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 410 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  26.25 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  37.66 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 130 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.85 
 
 		 459 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  22.9 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 358 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  22.88 
 
 		 421 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 118 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.31 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  24.04 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  36.23 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 132 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  27.23 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  32.31 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25.94 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  32.31 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  22.83 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  30.83 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  23.92 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  34.78 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 79 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  25.45 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  24.52 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  23.56 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  43.75 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  32.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>