137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0067 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  27.35 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.67 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0532  hypothetical protein  26.29 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000988933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  33.8 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 147 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 334 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 107 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  29.17 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00600  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 127 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1953  normal  0.198014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 176 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 296 aa  48.5  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  35.59 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 115 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 362 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.45 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 143 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.59 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  35.59 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.59 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  32.35 
 
 		 349 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  30.28 
 
 		 105 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0678  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  51.22 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 97 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 131 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 92 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 69 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.59 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.9 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  21.35 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 73 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.9 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 71 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>