127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2653 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  36.51 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 312 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 338 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  38.27 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1773  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 291 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  40.98 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  35.94 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.25 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  35.21 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 362 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  39.39 
 
 		 207 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3777  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  35.8 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 364 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0996  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  38.46 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  27.69 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5686  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  0.066363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 181 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 179 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 133 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 179 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 380 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.82 
 
 		 233 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  39.68 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  39.68 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  29.23 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  39.68 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  35.94 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.43 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 495 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.82 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>