204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2912 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  58.42 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  46.32 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  30.48 
 
 		 272 aa  84.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  32.23 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  32.2 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  33.61 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.67 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  34.17 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.78 
 
 		 374 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 364 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  29.75 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 348 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 322 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  38.81 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  25.98 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 364 aa  52  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  27.27 
 
 		 126 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  28.21 
 
 		 125 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 374 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  28.93 
 
 		 126 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  26.02 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  27.5 
 
 		 124 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 369 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.85 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  35 
 
 		 328 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  25 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  27.05 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 73 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  28.35 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 95 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  31.71 
 
 		 126 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  27.5 
 
 		 131 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  31.97 
 
 		 126 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  35 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 327 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 131 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 334 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 118 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  27.27 
 
 		 126 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  25.47 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  30 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  30.68 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  25.42 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  21.05 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  35.94 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2292  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2296  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2300  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2304  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 370 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.69 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  28.12 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  33.82 
 
 		 488 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>