41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12210 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  64.29 
 
 		 126 aa  177  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.97 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  49.22 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  52.08 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  46.77 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  47.06 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.35 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  45.16 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  45.83 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  54.35 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  45 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  45.9 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  44.72 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  44.26 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  42.98 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  43.33 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  42.98 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  45.45 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  43.09 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  42.74 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  43.33 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  42.98 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  43.44 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  41.8 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  39.17 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  39.17 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  35 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.8 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.53 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  32.65 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>