60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2591 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  100 
 
 
126 aa  261  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  70.63 
 
 
126 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
126 aa  190  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
126 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
126 aa  186  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  70.4 
 
 
126 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  67.74 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  66.67 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  66.12 
 
 
126 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  65.87 
 
 
126 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  66.13 
 
 
124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  65.32 
 
 
124 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  64.29 
 
 
126 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  65.6 
 
 
125 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  62.9 
 
 
124 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  61.6 
 
 
125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  60.32 
 
 
127 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  56.8 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 
125 aa  144  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 
126 aa  140  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  54.62 
 
 
125 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  53.28 
 
 
131 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  49.21 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  51.18 
 
 
131 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  49.19 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  43.55 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  47.15 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  46.77 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.06 
 
 
128 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.9 
 
 
126 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  42.5 
 
 
124 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  38.98 
 
 
121 aa  92  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  39.84 
 
 
128 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  38.21 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.59 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  38.66 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.35 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  39.6 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.2 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.05 
 
 
118 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  36.08 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  35.65 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  35.65 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.11 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  50 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.29 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  32.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  34.51 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 
198 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  41.46 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  51.52 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.52 
 
 
124 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  53.12 
 
 
216 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  53.33 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  53.33 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  53.12 
 
 
41 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  54.55 
 
 
41 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>