46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0405 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 		 118 aa  244  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  93.22 
 
 		 118 aa  229  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  93.22 
 
 		 118 aa  227  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  86.44 
 
 		 118 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  68.64 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  34.58 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.05 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  29.92 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.75 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  36.28 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  37.89 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  34.74 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  32.04 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  32.67 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  37.04 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.77 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  30.3 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  36.54 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  36.08 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  36.08 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  32.38 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  37.11 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.23 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.73 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  35.42 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  37.11 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.85 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  28.57 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  28.83 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  31.18 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  28.83 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.91 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.68 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  29.79 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  25.74 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.58 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  26.4 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  30.53 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  33.68 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.58 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>