51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0468 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 		 118 aa  237  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1631  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  59.48 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.591032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  51.94 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  51.94 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  58.97 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  50.78 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  50.41 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  44.88 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  47.66 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.48 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  42.02 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  41.35 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  36.92 
 
 		 181 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.29 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  36.94 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  37.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.9 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.75 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0990  hypothetical protein  31.73 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1185  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.96 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.46 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  40.59 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2950  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.1 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  35.92 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  34.21 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  33.02 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  37.37 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1257  hypothetical protein  29.13 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.537456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.95 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  35.92 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  36.89 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.63 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  32.69 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  37.25 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  35.35 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  36.11 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  36 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  31.68 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  35.35 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  26.55 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  35.92 
 
 		 126 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  38.83 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  37 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  37 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  32.35 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  35.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  34.31 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>