62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2514 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  262  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  73.6 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 		 126 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  70.4 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  69.92 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 		 126 aa  184  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  64 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  67.48 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  64.29 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  62.9 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  63.64 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  62.6 
 
 		 124 aa  169  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  63.2 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  61.79 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  57.72 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  58.4 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.54 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  57.38 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  54.4 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  50.82 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  50.81 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  53.23 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  52.03 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  45.08 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.2 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  42.74 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  43.9 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  39.2 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.83 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  42.15 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  39.39 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.04 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.67 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  62.86 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  62.86 
 
 		 55 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.27 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  34.02 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.46 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  60.61 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.65 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  59.38 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  36 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  48.65 
 
 		 41 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  45.95 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.99 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  50 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.29 
 
 		 39 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  30.09 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  48.65 
 
 		 47 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  35.42 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  50 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  53.12 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>