45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1404 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 		 187 aa  389  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.21 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1846  hypothetical protein  30.98 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  29.53 
 
 		 125 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  32 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  29.05 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  31.29 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  29.8 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09300  hypothetical protein  27.12 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.765683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08700  hypothetical protein  26.63 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.879602  normal  0.357827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  29.73 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  29.49 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.29 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  25.49 
 
 		 124 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  30.87 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  29.25 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  27.7 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  29.73 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  29.22 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  30.41 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  27.03 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  30.92 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.35 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  27.7 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  33.33 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  26.35 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  28.97 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  30.89 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  27.7 
 
 		 126 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  30.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  29.73 
 
 		 125 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  29.93 
 
 		 124 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  30.58 
 
 		 120 aa  51.6  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  27.03 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  26.67 
 
 		 126 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  26.53 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  24.36 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  26.4 
 
 		 124 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.63 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  31.82 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.93 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.93 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.77 
 
 		 124 aa  41.2  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>