42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  100 
 
 
124 aa  250  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  62.5 
 
 
126 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  49.22 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  48 
 
 
121 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  46.72 
 
 
128 aa  104  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.45 
 
 
128 aa  100  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  39.52 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  43.9 
 
 
126 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  46.22 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  41.13 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  41.94 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  41.67 
 
 
126 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  42.86 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  41.13 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  39.17 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  42.15 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  43.97 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  46.15 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  38.98 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  41.13 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  41.67 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  42.15 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  43.55 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  38.21 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  39.34 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  41.8 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  38.33 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  37.6 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  35.83 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  35.77 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  37.4 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  37.82 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.93 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.24 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2226  hypothetical protein  34.78 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  32.14 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  31.25 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  32.77 
 
 
280 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  31.86 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>