66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0140 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  74.6 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  73.6 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  73.39 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  70.63 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  70.4 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  70.63 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  68 
 
 		 126 aa  185  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  69.05 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  68 
 
 		 125 aa  180  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  67.2 
 
 		 126 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  67.46 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  66.4 
 
 		 125 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  63.33 
 
 		 126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  62.9 
 
 		 124 aa  167  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  63.2 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  60 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  61.6 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  55.91 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  56.56 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  57.14 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  55.28 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  55.12 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  52.85 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  48.39 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.93 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.06 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.35 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  38.76 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.83 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  41.94 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.29 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  38.18 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  27.03 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.78 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  36.21 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.59 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.3 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.42 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  35.42 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.42 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  38 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  33.02 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  33.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  32.5 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  67.74 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  60.61 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  60.61 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  58.82 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  61.11 
 
 		 41 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  64.52 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60.61 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  55.88 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.29 
 
 		 42 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.91 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  34.74 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  52.94 
 
 		 215 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  56.67 
 
 		 47 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  57.58 
 
 		 41 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>