51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1754 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  100 
 
 
128 aa  257  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  49.6 
 
 
128 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  52.08 
 
 
126 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  50 
 
 
126 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  46.72 
 
 
124 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.98 
 
 
124 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  43.41 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  40.16 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  38.76 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  46.43 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  35.94 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  39.84 
 
 
126 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  40.94 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  38.74 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  43.24 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  44.83 
 
 
131 aa  89.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  39.2 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  39.2 
 
 
126 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  38.89 
 
 
126 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  43.24 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  38.4 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  36.51 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  35.71 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  41.23 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  34.4 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  33.59 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  37.3 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  41.35 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  40 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  38.6 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  34.13 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  33.04 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  35.71 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  35 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  36.61 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  35.85 
 
 
115 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  37.84 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.21 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1830  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31.3 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.874785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  31.91 
 
 
181 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  34.78 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.72 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  30.53 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.58 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.79 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1514  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.79 
 
 
118 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  24.43 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.85 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  28.3 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>