45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1113 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  100 
 
 
126 aa  260  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  64.29 
 
 
126 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  62.5 
 
 
124 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  53.72 
 
 
128 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  46.4 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  50 
 
 
128 aa  110  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.24 
 
 
121 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
127 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 
125 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  46.34 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
126 aa  103  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  48.41 
 
 
126 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  42.74 
 
 
126 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  44.26 
 
 
124 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  43.9 
 
 
126 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  46.34 
 
 
126 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  45.08 
 
 
124 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  43.9 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  43.44 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  44.17 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  45.08 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  41.94 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  42.98 
 
 
131 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  43.65 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  40.83 
 
 
126 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  41.88 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  42.86 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  43.9 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  40 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  37.9 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  38.33 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  40.34 
 
 
131 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.29 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
200 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  36.61 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  37.89 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2226  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  31.75 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  29.91 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  37.5 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>