63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2714 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  100 
 
 
124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  68.55 
 
 
126 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  68.55 
 
 
126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  64.8 
 
 
127 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
126 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  62.9 
 
 
126 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  60.98 
 
 
126 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  61.67 
 
 
126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 
124 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  58.87 
 
 
124 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  57.72 
 
 
126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 
126 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 
126 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  61.79 
 
 
125 aa  157  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  56.45 
 
 
126 aa  156  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  57.6 
 
 
125 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  56 
 
 
126 aa  148  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 
126 aa  147  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  57.26 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  54.84 
 
 
125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
125 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  54.92 
 
 
126 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  53.23 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  48.78 
 
 
127 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  49.18 
 
 
126 aa  120  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  42.06 
 
 
128 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.08 
 
 
126 aa  100  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  43.44 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.65 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  38.4 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.87 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  37.5 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  25.49 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  35.09 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  38.6 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 
200 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1006  desulfoferrodoxin  36.19 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  30.83 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  30.83 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  29.75 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.86 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  54.55 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.69 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.55 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0907  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  29.63 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  47.62 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0331  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.67 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.770142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  51.43 
 
 
47 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0430  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  28.42 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45.95 
 
 
41 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  50 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  52.63 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  27.73 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0405  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  30.53 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0832584  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  52.94 
 
 
42 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1362  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.57 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  50 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  32.26 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  50 
 
 
41 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>