39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2736 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  100 
 
 
41 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  82.5 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  77.5 
 
 
42 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  75 
 
 
41 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  64.71 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  63.89 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  67.74 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  58.82 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  58.82 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.82 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  59.46 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.82 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  55.56 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  56.25 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.97 
 
 
55 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  72.41 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  60 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  54.05 
 
 
124 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  68.97 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  66.67 
 
 
38 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  50 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  48.65 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  62.07 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  58.62 
 
 
214 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  65.52 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  51.61 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  62.07 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  51.43 
 
 
39 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  50 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>