37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0164 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  100 
 
 
41 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  82.5 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  77.5 
 
 
42 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  70.73 
 
 
41 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  65.71 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  67.74 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  58.33 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  62.5 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  58.33 
 
 
125 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.54 
 
 
55 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  67.74 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  62.07 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  60 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  72.41 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  61.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  51.52 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  58.06 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  65.52 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  63.33 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  45.95 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  64.71 
 
 
38 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  50 
 
 
47 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  51.52 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  65.52 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  54.55 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  60 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  44.44 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  50 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  53.12 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  53.12 
 
 
126 aa  40  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>