18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0162 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  100 
 
 
38 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.76 
 
 
42 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  57.58 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  54.05 
 
 
39 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
41 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  66.67 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  58.82 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  58.06 
 
 
47 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  57.58 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  64.71 
 
 
41 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  63.33 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
125 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1284  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  53.12 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.1144  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  60.61 
 
 
41 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  65.52 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>