40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1369 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  98.18 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  100 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  96.36 
 
 		 55 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  59.52 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  57.14 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  62.86 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  61.76 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  55.26 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  60.53 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  58.33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 41 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  61.11 
 
 		 39 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  64.52 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  54.76 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  60.61 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  48.65 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  68.97 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  58.82 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  57.14 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  58.82 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  45.24 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  56.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  52.78 
 
 		 41 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  54.55 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  56.67 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  51.43 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  55.88 
 
 		 42 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  59.38 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  53.12 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  53.12 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  46.15 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  56.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  66.67 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  62.07 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  53.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  48.57 
 
 		 126 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>