43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0773 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  50.81 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  52.46 
 
 
124 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  47.93 
 
 
127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  47.9 
 
 
131 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  47.58 
 
 
126 aa  117  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  47.93 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  47.97 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  50 
 
 
126 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  45.45 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  47.5 
 
 
126 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  45.83 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  44.63 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  47.93 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  46.67 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  46.72 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  47.97 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  44.07 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  45.83 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  47.46 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  44.63 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  42.5 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  43.44 
 
 
127 aa  104  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  40.65 
 
 
126 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  44.54 
 
 
125 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  42.5 
 
 
126 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  40.65 
 
 
131 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  40 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.15 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  34.71 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  32.91 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  28.69 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  35 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  33.61 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  31.97 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  39.18 
 
 
181 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  26.4 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  41.67 
 
 
55 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0162  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  51.61 
 
 
38 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  50 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  50 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.91 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>