59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1558 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1558  desulfoferrodoxin  100 
 
 
127 aa  258  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1133  desulfoferrodoxin  68.25 
 
 
126 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0140  desulfoferrodoxin  67.46 
 
 
126 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.450911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2870  desulfoferrodoxin  67.72 
 
 
126 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000041759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3891  desulfoferrodoxin  68.8 
 
 
125 aa  173  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2714  desulfoferrodoxin  64.8 
 
 
124 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.174958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2481  desulfoferrodoxin  64.8 
 
 
124 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0204  desulfoferrodoxin  65.08 
 
 
126 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2347  desulfoferrodoxin  65.08 
 
 
126 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000622634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0956  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2514  desulfoferrodoxin  59.68 
 
 
126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.404176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3292  desulfoferrodoxin  62.4 
 
 
124 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000389182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2010  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
126 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000133661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0011  desulfoferrodoxin  59.38 
 
 
131 aa  157  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0362787  hitchhiker  0.00695509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3193  desulfoferrodoxin  59.06 
 
 
126 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000535663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1201  desulfoferrodoxin  60.8 
 
 
126 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0125011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0680  desulfoferrodoxin  59.52 
 
 
125 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1492  desulfoferrodoxin  63.71 
 
 
125 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.291196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0945  desulfoferrodoxin  60.48 
 
 
131 aa  154  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.050046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2513  desulfoferrodoxin  59.17 
 
 
126 aa  153  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2591  desulfoferrodoxin  60.32 
 
 
126 aa  153  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000531633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1285  desulfoferrodoxin  61.11 
 
 
125 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00505096  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2085  desulfoferrodoxin  55.12 
 
 
126 aa  140  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05310  desulfoferrodoxin  53.54 
 
 
127 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0704748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0613  desulfoferrodoxin  53.17 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0173  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  52.71 
 
 
127 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0773  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  47.93 
 
 
124 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139157  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3474  desulfoferrodoxin  50.41 
 
 
126 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.329181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1924  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  45.31 
 
 
128 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1113  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  44.35 
 
 
126 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000682387  hitchhiker  0.0000000000000162941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12210  Desulfoferrodoxin  44.35 
 
 
126 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000356976  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0897  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  47.25 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0217374  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0987  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  40.8 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1754  desulfoferrodoxin/neelaredoxin  41.23 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.432548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15140  Desulfoferrodoxin  41.13 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.961008  normal  0.204633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1404  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.49 
 
 
187 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2613  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0720  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding domain-containing protein  35 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0429  Superoxide reductase  33.33 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0835  neelarodoxin  39.13 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000426651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0880  Desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  37.5 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000131098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1636  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  45.24 
 
 
47 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2736  desulfoferrodoxin FeS4 iron-binding domain-containing protein  60 
 
 
41 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1623  desulforedoxin, putative  57.14 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1369  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  57.14 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1505  desulfoferrodoxin Dfx domain protein  57.14 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0305  Desulfoferrodoxin Dfx domain protein  55.88 
 
 
41 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1576  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  58.82 
 
 
39 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0164  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  63.33 
 
 
41 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0079  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  60 
 
 
42 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  60 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2207  desulfoferrodoxin, ferrous iron-binding region  31 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0273  superoxide reductase  33.91 
 
 
131 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0271  superoxide reductase  33.91 
 
 
131 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0007  Superoxide reductase  29.03 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0468  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  34.31 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000114138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0477  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  29.31 
 
 
118 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.243241  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  47.37 
 
 
215 aa  40  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>